在拥有质量可靠的机器后，还必需严格遵循必要的注意事项，才能更好发挥作用。所谓铁打的营盘流水的兵，实验室里学生一批批进来又毕业，特别要严格培训才能减少意外发生。还记得多年前学校里一世行贷款的大离心机坏了请老外来维修，看看离心腔壁上液迹斑斑，残留在个别转子孔里面临时平衡用的草纸或者胶垫，学生们配平时的随随便便，老外嘀咕了一句——难以相信中国著名学府的研究生是这样做实验的。类似的话在若干年后又听到了多次，比如上海送来维修的一把自动测序的排针式上样器——上样的细金属针应该浸泡清洗，但是却被用火烧来消毒——针都堵掉了，或者被人为地扭曲或折断了，当时也有人问——这就是你们中国最好的学府、最好的实验室、最好的学生用过的？每一次听到都一样的无地自容。其实很多仪器的损坏仅仅是因为我们怕麻烦、马虎一点或者想省点事——也许当时没有立即出问题，但损坏却一点一点的累积下去。每个学生都严格一点，不单可以减少无谓的损坏，也可以使实验顺利很多。
1.样品的装载和平衡 由于离心时产生很大的离心力。当转子所带的样品不平衡时会产生很大的力矩，轻者引起机器发抖和震动，重者会扭断转轴造成事故。因此离心样品的平衡装载是特别要注意的问题。离心转速越高，对平衡的要求也越高，除了小型离心机转轴较软有一定调节能力而允许目测平衡外，所有离心机均要求用天平平衡样品。离心管至少要两两对称平衡，或者三个一批对称平衡，最好是一样重。水平转子不要空转。在平衡时不仅要保证对称的两管样品等重，还要保证二者密度和体积相当。因为离心时产生的力矩不仅与样品的重量有关，还和样品的旋转半径有关。例如一管水和半管砂子虽然重量相等，但半管砂子的旋转半径要大一些，所以力矩相差很大，转动起来并不平衡。所以处于对称位置的两个离心管必须装载密度相近的样品。例如要同时离心两个样品，一管是用蒸馏水稀释的，另一管是用60%的蔗糖配制的。虽然两管重量相等，但不可配成一对离心，而必须另装一管水和一管60%的蔗糖作为平衡物分别配重，否则不能正常运转。
2. 转子的保管和使用要严格按照说明。
3. 离心管的选择应该参照离心管的说明和材料，防止不适当的使用导致破裂，不但损失样品还会污染转子和离心机。在超速离心时为了减小阻力，都是在真空状态下运行。所以除了不锈钢和厚壁聚碳酸脂(PC)离心管外，样品必须装满，否则离心管会因真空而变形或破裂。常规的高速或者低速离心则不要装满，所有带盖的转子、水平吊篮、试管盖都要盖紧，防止样品外泄而失去平衡。使用角转子时必需盖转头盖，否则离心腔内会产生很大的涡流阻力和摩擦升温，这等于给离心机的电机和制冷机增加了额外负担，影响离心机的使用寿命。